Lorsqu'un ennemi inattendu apparaît soudain et menace la sécurité nationale, Nick Fury, directeur de l'agence internationale connue sous le nom de S.H.I.E.L.D. (Supreme Headquarters, International Espionage, Law-Enforcement Division), forme une équipe de super-héros pour rétablir la paix et l'équilibre dans le monde. Un effort de recrutement colossal commence alors pour trouver les meilleurs candidats.